苏俄小心翼翼地维持着波罗的海的假象，但是当英法自身难保的时候这种假象就没必要维持了，信守互助条约的政策被立刻撕毁，
就在法国投降前夕，苏方声称在立陶宛的驻军中有一名士兵失踪，随后苏俄立刻照会立陶宛政府停止挑衅，否则苏俄将采取特别措施，立陶宛政府为了止息苏联的愤怒，第二天答复要立即进行详细调查，并且成立了调查委员会。
立陶宛为了防止事态发展，一方面表示衷心欢迎莫斯科当局对查明事件提出的一切要求，一方面进行了一系列逮捕，并且加强了对苏军驻地附近居民的监视。
立陶宛总理和外长先后飞赴莫斯科跟苏方谈判，力争能够解决冲突，甚至应莫洛托夫的要求，免除了内政部长和政治警察署署长的职务，表达了解决这一事件的诚意。
但是苏俄根本不理会这样的诚意，直接表示有波罗的海三国缔结军事同盟阴谋反对苏俄的实质性证据，随后要求立陶宛成立新政府，在孤立无援的情况下立陶宛被迫接受一切要求，立陶宛被迫就犯之后，莫斯科当局故技重施向拉脱维亚和爱沙尼亚公使递交声明。
指责两国签署的波罗的海协定，要求两国立即成立新政府，同时限令6个小时作出答复，两国政府势单力薄，在规定时间内接受苏俄提出的条件，原来的政府宣告辞职。