切萨雷死后，波吉亚家族的成员几乎全部被赶出了梵蒂冈，连卢克蕾西亚最小的弟弟杰弗里也只能龟缩于自己的领地之中。
而好在当时卢克蕾西亚已经远嫁费拉拉许多年，积攒了一定的人脉与声望，在她第三任丈夫费拉拉公爵阿方索一世的支持下，救助了许多波吉亚家族的成员，其中便有兄长的私生女小卢。
在她想家的时候，她就会来到修道院，看着小卢那张标准的波吉亚成员面孔，她就能稍微感到平静一些。
于是在这一年的夏天，她产下一名女婴之后感染了严重的疾病，在费拉拉最好的医者都束手无策的情况下，她温柔地对守在自己床边的丈夫说，可不可以让她在贝尔纳迪诺修道院度过最后的一段时光。
阿方索一世知道她想家了，便点了点头，吩咐侍从们去安排，最后握着她的手，说：“我会每天来看你的。”
卢克蕾西亚笑了笑，说：“那我非常期待。”
阿方索一世曾以性格古怪爱好奇特而闻名。
他喜爱大炮、联赛、狗和马，以及中世纪的管弦乐和陶艺，也因此，费拉拉出产的大炮极为有名，而因为他极其偏爱鲁特琴，所以费拉拉成为了鲁特琴的编奏中心。
那一年，因为教皇与切萨雷想与法国结盟，于是便谋杀了卢克蕾西亚的第二任丈夫，与法国敌对的那不勒斯国王私生子比谢列公爵。
刚生产完的她完全陷入了崩溃，第一次在父亲罗德里戈的面前脱下了自己所有关于乖巧听话的面具，站在波吉亚寓所的门口大声咒骂着自己的父兄，最后被教皇连夜送到了她的属镇奈比。
为了逃离罗马这座监狱，她争取到了与费拉拉公爵埃尔莱科一世的儿子，阿方索一世的婚约。