“带下去和那些士兵关在一起吧！”王承恩也懒得和一个将死之人啰嗦，直接让人把阿库拉一家分开，阿库拉和他的儿子和士兵关在一起，他的夫人和女儿则关在了女牢。
“我是贵族，你们不能这样对我！”阿库拉拼命喊叫着，然而这些并没有什么卵用，这可是大明的势力范围，不讲究欧洲那些规矩；而且阿库拉可不只是战败的俘虏，他同时也是屠杀了两万多大明子民的刽子手，这种人还能给他什么好待遇？
拿下马尼拉城之后，俞咨皋和郑芝龙留下一部分人驻守，剩下的兵分两路，不断扫除以西巴尼亚人、弗朗机人和荷兰人在东南亚的殖民据点，直到旧港宣慰司原有的领土上所有殖民据点被清除干净才返回马尼拉。
回到马尼拉之后，王承恩和郑芝龙、俞咨皋马上按照旨意找来上次屠杀的幸存者，当着所有百姓的面对阿库拉等人进行了公开审判，凡事参与到此事中的以西巴尼亚人，当地土著，以及少数为虎作伥的大明商人，统统被判处死刑。
那些底层士兵和基层军官当场被斩首示众，阿库拉等高级官员则在参观了行刑现场后被重新押上船只，他们将被带到京城执行死刑。
“这简直是太野蛮了！”看到自己的手下被处死之后，阿库拉愤怒地喊道，同时他也隐隐地猜到了自己即将迎来的命运，这绝对不是一个好消息。