有毒气体与固体尘埃阻拦阳光热量到达地面，导致原本植物的光合作用停止，大气和海洋温度开始急剧下降。
这一系列事件的结果就是大冰期再次降临，整个世界的洋流因此发生紊乱，而随着大量水份以冰雪的形式固定下来，也让海平面开始下降。
浮游生物在这一系列浩劫中首当其冲，随着大批大批的浮游生物饿死或者冻死，最底层的食物链开始崩塌，从而引发了恐怖的连锁反应，带来“泥盆纪大灭绝”的第一波高潮。
这个时期主要是海洋生物受到波及，那些逃去淡水和陆地的玩家，勉强躲过这一波大灭绝的冲击。
可他们没有办法躲过第二波大灭绝高潮，也正是这紧随而来的第二波高潮，彻底将“泥盆纪”时代给终结。
而第二波大灭绝高潮的推动者，依旧是生物圈灭绝制造机植物，因此但就引起大灭绝这一方面，动物中如果没有人类这个存在的话，真的没法与植物相提并论。
那些因为陨石撞击而迷茫在大气层中的烟雾，经过一千多万年的岁月冲洗之后，终于缓缓开始消退，让生物圈迎来了短暂的回光返照。
之所以说是回光返照而非复苏，是因为最先从第一波大灭绝高潮中复苏的是植物，大量复苏的植物开始进行光合作用。
然而这个时候动物和腐生真菌，却还未能从大灭绝中复苏，因而没有办法跟得上植物的消耗，这导致二氧化碳的浓度开始下降。
虽然以人类的视角来看，植物导致的二氧化碳浓度下跌速度非常缓慢，但问题是地质年代的时间尺度，可是以十万年为单位打底。
最终这种二氧化碳浓度的下跌，导致地球温室效应开始减弱，结果还没从上一轮冰期中恢复过来的玩家，又遭遇到了新一轮冰期，其击破了因尘埃消退导致的热量复苏。
这个时代还发生了一件古怪的事情，因为氧气含量节节攀升，植物开始大量吸收氮和磷，生长的速度非常快。
然而在海洋中遏制植物的重要存在浮游生物，却还没从第一波灭绝高潮中复苏过来，于是在大气氧含量十分充足的情况下，海洋却出现了大缺氧事件。
鱼类生物玩家纷纷表示这真是日了狗了，肯定是在针对他们啊，毕竟节肢类早就run到地面上去称王称霸了。
当海洋处于缺氧环境的情况下，生物遗骸不是被正常分解，而是被转化为对生物有害的有毒物质。
因此泥盆纪大灭绝第二次高潮时期的海洋，是浑浊腐臭的可怕存在，对诸多生物来说宛如一座巨大的坟场。
大量多细胞生物在这场浩劫中被一扫而空，以至于寒武纪时代那些细菌和蓝藻，居然能够时隔千万年后重新大量繁殖。
他们对生物遗骸的分解，进一步释放出各种有害毒素，一层层将食物链给摧毁，从底层猎食者到顶层猎食者无一幸免。