过了一个多月，忽然有警报传李，说是金军已经兵分九路南侵。原来仆散揆听说宋军败退，于是定下九路南侵的计策。他亲自率兵三万出颍、寿，完颜匡率兵二万五千出唐、邓，纥石烈子仁纥石烈率兵三万出涡口，纥石烈胡沙虎率兵二万出清河口，完颜充率兵一万出陈仓，蒲察贞率兵一万出成纪，完颜纲率兵一万出临潭，石抹仲温石抹率兵五千出盐川，完颜璘率兵五千出来远。
金军九路依次南下，弄得韩侂胄寝食不安，只好重新命两淮宣抚使邱崈，令签书枢密院事，督督促巡视江、淮军马。金将胡沙虎自清河口渡淮，围困楚州，淮南因此大震。有人劝邱崈弃淮守江，邱崈怫然不悦道：“我如果放弃淮河，敌军便可以兵临长江，我们就和敌人共有长江险阻，此事岂可行？我们当与淮南共存亡！”于是增兵防守，日夕戒严。
金兵大举进攻，势如破竹。完颜匡攻陷光化，进入枣阳。江陵副都统魏友凉，突围南逃。招抚使赵淳，焚烧樊城连夜逃走。仆散揆也引兵至淮，潜渡八叠滩。守将何汝励、姚公佐，仓猝溃走，自相践踏，死亡无数。仆散揆夺取颍口，攻下安丰军和霍邱县，围攻和州。纥石烈子仁一军，攻破滁州，进入真州。郭倪派兵增援，结果不战而溃，郭倪于是放弃扬州而逃。
幸亏亏毕再遇引兵赶到六合，截住了金兵。再说毕再遇回到泗州后，因为军功第一，从武节郎超升为武功大夫，被任命为左骁卫将军。这时，新任江淮宣抚使丘崈为"全淮东兵力，为两淮声援"，传檄文让郭倪撤回惟扬，旋即放弃"孤立"之泗州。毕再遇也奉命回盱眙，并任知盱眙军，以防止金军切断两淮宋军的联系。不久后，毕再遇被改授为镇江中军统制，仍知盱眙军。因为凤凰山的战功，毕再遇又被授为达州刺史。
开禧二年冬十月，金将胡沙虎率领步、骑兵数万及战船五百多艘自清河口渡过淮河，停泊在楚州、淮阴之间，包围楚州。江淮宣抚司传檄文让毕再遇援助楚州，派段政、张贵等代替他守盱眙军。结果毕再遇才离开盱眙，金军便马上展开攻击，段政等惊慌溃退，致使盱眙失陷。毕再遇闻讯回师，收复盱眙，被任命为镇江副都统制，随后才赴援。
金军有七万人屯驻于楚州城下，有三千人在淮阴看护粮草，又有三千艘载粮船停泊在大清河。毕再遇探知后说道：“敌人是我们的十倍，我们难以力胜，可用计攻破敌人。"于是派统领许俊从小路奔淮阴，晚上二更时，士兵口中含枚，鸦雀无声地到达敌营。宋军每人携带火种潜入，埋伏在五十多处粮车之间，听到哨声就放起火。金军惊慌逃窜，乌古伦师勒、蒲察元奴等二十三人被活捉。
开禧二年十一月，金军从黄狗滩渡过淮河，涡口守将望风而逃，濠、滁二州相继失守，金人又攻破安丰军。毕再遇对众将说道：“楚州城坚兵多，敌人粮草已空，我所担心的只有淮西。六合是最重要的，敌人一定会集全力攻打它。"于是率兵赶赴六合。
金军距六合只有二十多里路时，毕再遇命令城上偃旗息鼓，自己亲率精兵伏于南门。到了城下，金军马上渡濠登城。此时，城上突然鼓号声齐鸣，旌旗并举。这一静一噪的反差使金军始料不及，惊恐万状。毕再遇趁机从南门杀出，金军狼狈不堪，拼命溃逃。
此仗之败，让金将纥石烈种塔勃然大怒，调集十万大军将六合团团围住，连续强攻。城中宋军的箭很快用完，没有弓弩之利，宋军难以战胜数量上远胜于己的金军。毕再遇命人在城上撑起青盖，在草人身上穿上衣服，头上戴着盔甲，在城墙上来回移动。金军以为是宋军将士巡视，争先恐后以强弓劲矢齐发，疾如暴雨，射在草人上的箭密如刺猬，宋军获得箭矢二十多万支。
纥石烈种塔率兵退走，不久又增兵围城，六合城四面的金军营帐绵延三十里。毕再遇把城中的乐手集中起来，在临近城门的地方鼓吹演奏，管弦之声不绝于耳。城中守军听到音乐，情绪轻松，人心稳定。城外金军则被迷惑，一旦他们麻痹懈怠，毕再遇就出动少量骑兵，不分昼夜袭扰，使金军得不到休息，终日张惶惊恐。六合久攻不下，金军只得退去。
毕再遇估计金军将会再来，就亲自领兵夺下城东野新桥，出现在敌后。金军逃走，他追军到滁州，赶上大雨雪，方才回师。六合一役，宋军缴获了金军骡马一千五百三十一匹、鞍六百套以及众多的铠甲、旗帜。
金军解除对六合的包围之后，毕再遇亲自率领士兵绕到敌后，把事先用香料煮好的豆子撒满地面，然后进攻敌人。金军追来，毕再遇且战且退，将其引入预定地点。此时天至傍晚，正是人困马饥的时候，金军马匹闻到豆香就驻足吃豆，任凭怎么抽打也不肯舍下美食。金军因此阵容混乱，毕再遇伏兵齐出，再次大获全胜。
毕再遇率领宋军与金军对垒，虽有小胜，可是无奈金军增兵渐多，宋军渐渐处于寡不敌众的形势之下。审时度势，毕再遇决定撤退。如何让宋军安全脱身，成为毕再遇思考的问题。金军营寨和宋营相距很近，近得能够听到宋军军营一天到晚鼓声不断。对于宋军的鼓声有什么作用，金军心知肚明。宋军天天击鼓，金军也在调兵遣将，准备决战。一连几天后，金军发现，宋营的鼓声逐渐变得微弱，金军将领觉得时机成熟可以进攻了，便率军小心翼翼地靠近宋营。
当金军冲进宋营时，宋营外围并无防范，可是一进到宋营内，所有的金军都傻了眼，宋营除了旗幡招展之外，竟是一座空营。宋军官兵早已撤离，连一个人影都没有。仔细检查，金军惊奇地发现宋营内的每一面鼓上都吊着一只羊，羊的两只前蹄顶在鼓面上。羊被悬空捆起来，自然难受得要命，便使劲挣扎，两只前蹄不停地乱踢，于是击响了战鼓。借着一片鼓声掩护，宋军早已经悄悄撤军数日了。可金军听到宋营仍然鼓声不绝，竟好几天都不加怀疑，等到金军发现上当，为时已晚。
此后，毕再遇被任命为镇江都统制兼权山东、京东招抚司事。他回到扬州，被授为骁卫大将军。金兵围楚州已经三个月，列营六十多里。毕再遇派将分道阻击金兵，军威大振，解去楚州之围。随后，毕再遇兼知扬州、淮东安抚使职。
扬州有北军二千五百人，毕再遇请求让他们分别隶属建康府、镇江府各军，每队不超过数人，使他们无法造反。敢死军，本是乌合亡命的军队，毕再遇能驾驭，使兵士尽其材力。陈世雄、许俊等都是毕再遇推荐的。毕再遇的部将张健雄仗自己勇武而桀骜不驯，毕再遇列出他的罪状上奏给朝廷，按军法处斩张健雄，众将畏服。
仆散揆听说进展不利，便想通好罢兵。他找到韩琦的五世孙韩元靓，派遣他渡过淮河，去见邱崈。球崈问他为什么事而来？韩元靓道：“两国交兵，北朝都说是韩太师的意思。现在相州宗族坟墓，都不可保，只得偷偷南来，依靠太师。”邱崈又问金国情势以及和战大略。
韩元靓这才露出讲和的意思，球崈派人护送他北回，令他去求来金帅的文书，方可议和。不久，韩元靓又来到，得了仆散揆的来函，约定了议和的条款。邱崈这才上表奏闻，韩侂胄已急于讲和，于是谕令邱崈主持和约。邱崈于是派遣刘佑拿着书信去见仆散揆，表示愿意讲和休兵。
仆散揆说道：“宋朝必须称臣割地，献出首祸，才可言和。”刘佑回来禀告，邱崈派遣王文再去金国，说道：“用兵是苏师旦、邓友龙、皇甫斌等人所为，并非朝廷之意。现在三人都已被贬，无庸再议此事了。”仆散揆又说道：“韩侂胄如果无意用兵，苏师旦等人怎敢专权？此话未免欺人。”于是派遣王文回来禀报。邱崈又遣使者继去，答应归还淮北的流民，以及本年岁币。仆散揆这才暂时答应停战，从和州退到下蔡，再行正式议和。韩侂胄听说金人想问罪首谋，恐怕和议不成。他又派人去督促吴曦进兵，希望获得一胜，或许得以容易谈和。
吴曦接到命令，于是假装派兵攻打秦陇，暗中却在等待姚巨源回报消息。等姚巨源回报，说金国已经答应封他为蜀王，并要他收兵，关闭边境。吴曦于是令部将王喜等退兵。金将蒲察贞因此进入和尚源，攻陷西和州，乘势进攻大散关。
吴曦率军节节退让，金将完颜纲遣使和他相会，命令吴曦献出诰敕。吴曦按照金国要求全部交付，完颜纲于是传达金主诏命，派遣马良显赍给书印，封吴曦为蜀王。吴曦秘密拜受，于是退回兴州。这天，天赤如血，光焰烛地。