当时也先挟持英宗回京，要求守城者开门，于谦等大臣拥立郕王为帝，遥拜英宗朱祁镇为太上皇。并亲自守城拒绝英宗回京。
土木堡战败，勋贵集团损失了大量的中坚骨干，再加上战败的影响，一时间
陷入了低潮。而以于谦为首的文官们则在击退了瓦剌兵马之后走上巅峰！
本来明朝的军事最高权力机构是五军都督府。而在北京城保卫战的时候，于谦等文官越过五军都督府掌握军队的权利，直接调动兵马反击瓦剌，这在当时看来是权宜之计。
但是北京保卫战结束之后，文官们却没有归还这项权利。反而把调动军队权力放在了兵部，彻底架空了五军都督府。而当时新登基的皇帝迫切的需要文官的支持，所以就默许了这件事。
景泰八年，武官石亨、文官徐有贞、太监曹吉祥等人拥戴被朱祁钰囚在南宫的明英宗朱祁镇复位，史称“夺门之变”！而在英宗重新登之后，皇帝五军都督府，都督府掌握军队的这项权利他也没拿回来，彻底的被文官把持住了！
于是在之后相当长一段时间里，文官们为了利益开始向前宋一样摆弄勋贵、武将。而勋贵集团损失了大量的中坚骨干之后也无力发声，所以导致武人的地位一降再降！军心士气全无，任凭文官摆弄！甚至国内外出现战事，都要派文官去指挥。
这种况随着时间的推移越来越严重。以至于到明朝后期的时候，一个正五品的武官见到一个七品县令都要大礼参拜。就连戚继光那样的英雄好汉给张居正写信，落款都要写上“门下走狗”的字样！可见当时武人地位之低。
但这也不能说明勋位武人就无力反击了。那些勋贵们本省就扎根在军方，他们还不断的相互联姻，层层叠叠的盘踞在军方上下各处。如果他们真的团结起来，力量也非常强大的。所以文官们虽然压制住了勋贵武人们，但是也不敢把事做的太过分。
像这次刘佩报功的事。如果仅仅牵扯上两个县令，他们是万万抵挡不住眼睛都红了的这些勋贵！这毕竟是破军杀将的大功啊，怎么可以放过！功劳占了，再报上去，又能将不少子弟塞进军方，把持住更多的利益！