66号指令是预先植入克隆人士兵脑中生物芯片的150条紧急指令之一，这些指令包括了各种极端情况，比如67号指令就是议长叛国的处理方式。而66号指令，对应的就是绝地武士团叛国的处理。
这些指令都是正常士兵可能很难接受和难以下手的，所以通过生物芯片的方式强制他们执行。
其实这些指令以及生物芯片的存在，绝地武士团也是知道的，这并不是什么秘密。当时塞弗-迪亚斯大师签字同意克隆人士兵的项目，以及后来派驻卡米诺星球监督克隆人士兵生产的莎克-缇大师都知道生物芯片和这150条指令的事情。
但问题就在于，66号指令的执行逻辑上，有一个细微的文字游戏。这个文字游戏在报送样本给绝地武士团看的时候并不存在，只是在实际生产的时候存在，绝地武士团并不懂生物技术，看到真正形成代码的150条指令，也分辨不出来其中的区别。
这个文字游戏就是，其它的149条指令如果要执行，都必须要包括议长、绝地武士团、最高战略司令部、共和国情报部等部门的同意，或者是如果涉及到这些部门的指令，也需要其它部门共同签署才会执行。
而66号指令，议长自己就可以直接下令执行，接下来他只需要对其它部门进行告知就可以了！
所以当时达斯-西迪厄斯只需要自己有一个理由支撑自己作出绝地武士团叛国的判断，那么他马上就可以执行66号指令。溵