后来佛道相争，道门和儒门联手灭了中土佛门，大量佛门僧人要么做了道士，要么成了儒生，反正三教合一是大势，许多义理相通，没有太大区别，不过是换一身衣裳的事情，真是来去自如。早在林灵素时代，中土佛门就有过投降的先例，如今道门势大，不能力敌，又有先例和退路，中土佛门自然不会硬拼到底，这也是中土佛门一触即溃的原因所在。
如今与道门抗衡的佛门其实是指西域佛门。
如果说中土佛门吸收了儒道两家之长，由小乘变为大乘，总是带着一股子仙气和书卷气。那么西域佛门就是吸纳了萨满教之长，其特点便是残忍，各种人皮、人骨法器层出不穷，充斥着极为浓厚的蛮荒血腥气息。
还有婆罗洲的佛门，受巫教影响。婆娑洲的佛门，受婆罗教的影响。都拜佛祖，可教义截然不同。
凤麟洲的佛门自然也是如此，受凤麟洲本土教派的影响，凤麟洲的佛门与中土佛门相似又不相似，寻本追源，凤麟洲佛门与中土佛门一脉相承，可在佛经的解读和戒律的传承上，大相径庭，比如中土佛门的弟子必须食素、出家，凤麟洲的佛门弟子却可以吃荤成家，而且凤麟洲的佛门势力没有经受过三番五次的“灭佛”打压，势力极为庞大，如同藩镇一般，蓄养僧兵，不容小觑。
他们对于道门相当敌视，只是惧怕道门的实力，表面恭顺。
再有就是凤麟洲的本土教派天门。最早的时候，天门没有正式名称，一直到佛门传入凤麟洲，渐渐在当时的凤麟洲传播开来，为了与佛门抗衡，于是有了天门一说，以凤麟洲固有的天门，区分域外传来的佛门。
天门又称天之神道门或者神道教，语出中原的《易经》：“大观在上，顺而巽，中正以观天下。观，盥而不荐，有孚颙若，下观而化也。观天之神道，而四时不忒，圣人以神道设教，而天下服。”
后来道门势大，为了与道门区分，不被误会是道门的分支，干脆把神道去掉，于是就成了天门。
最早的时候，天门完全不是佛门的对手，彻底沦为佛门的附庸，天门中的诸神也成为了佛门的护法。直到儒门的理学兴起。
道门因为玄学而从道家变为道教，儒门则因为理学从儒家变为儒教。理学强调天理，使天理成为儒门之至高神，人间帝王便是天理在人间的代言人，是为天子，又是万民君父，张月鹿曾在三教大会时批判过理学。可不得不承认，理学能够得到帝王的支持，的确是抗衡佛门的利器，不仅让理学圣人成为儒门四圣之一，也将儒门推上了三教之首的宝座。
待到理学传至凤麟洲后，天门与理学相结合，强调尊皇忠君，使得天门脱离佛门的掌控开始独立，这便是今日“尊王”的由来。后来摄政关白架空皇帝，自然是有违忠君的理念，所以无论道门是否进入凤麟洲，反对摄政关白的人都是曾出不穷，上至公卿，下至落魄武士。
后来天门又吸收了圣廷的教义，开始鼓吹凤麟洲为天下中心，逐渐成为凤麟洲的国教，凤麟洲皇帝既是各地藩主共同拥戴的君主，又是天门的教主。